Управление общеобразовательным учреждением осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации, Уставом МБОУ ЗАТО г.Североморск «Лицей №1» и строится на принципах единоначалия и коллегиальности.
К коллегиальным органам управления относятся:
- Педагогический совет
- Общее собрание работников Лицея
Полномочия и состав органов самоуправления регламентированы в Уставе МБОУ ЗАТО г.Североморск «Лицей №1».
Филиалов и структурных подразделений нет.